一個被感染的細胞可以製造許多病毒顆粒。這些後代進入其他細胞,又會啓動下一輪複製。病毒數量能夠在短時間內明顯增加,但持續增長需要細胞不斷提供材料,也需要後代不斷找到適合感染的新細胞。
《擴散領域》讓玩家指揮病毒集羣,在細胞之間建立複製點、產生新的單位。隊伍達到人口上限後,複製就會停止。現實中,病毒增殖也會受到細胞數量和資源供給的限制。

一個細胞的生產能力有限
病毒增殖要完成遺傳物質複製、蛋白質合成和顆粒裝配等步驟。複製遺傳物質需要核苷酸,製造蛋白質需要氨基酸和細胞的翻譯系統;帶有包膜的病毒,還需要取得膜成分。
這些步驟的速度可以不同。遺傳物質複製得很快,外殼蛋白卻可能來不及供應;蛋白質已經合成,後續裝配和釋放也可能受到限制。完整病毒顆粒的產量受整條過程影響,增加遺傳物質的數量,未必能讓具有感染能力的後代同比增加。
單細胞實驗中,研究者觀察到過這樣的情況:進入細胞的病毒增多後,細胞內產生的病毒遺傳物質明顯增加,具有感染能力的顆粒產量卻沒有相應上升。研究提示,顆粒生產存在細胞資源方面的限制。具體限制來自哪些環節,需要結合病毒類型和細胞條件繼續判斷。
細胞能夠維持病毒生產的時間也有限。感染造成的損傷、細胞自身的防禦反應,以及免疫細胞清除被感染細胞,都可能終止生產。有些細胞會在感染後啓動凋亡程序,病毒還未完成的複製和裝配過程也會隨之中斷。

後代還需要找到新的易感細胞
病毒從一個細胞中釋放後,只有部分顆粒能成功建立下一輪感染。它們需要接觸合適的細胞,完成結合、進入和後續複製。能讓病毒進入的表面條件,以及能支持複製的細胞內環境,都會影響這一步。不同組織和細胞類型能夠提供的條件有差別。
感染初期,如果周圍可感染的細胞較多,一批被感染細胞產生的後代就有機會感染更多細胞。開始生產病毒的細胞數量增加,病毒總量便可能在一段時間內近似按指數增長。
隨着感染推進,部分細胞已經被感染、受損或死亡,剩餘易感細胞減少。抗病毒信號也會改變周圍細胞的狀態,例如干擾素可以促使細胞增強抗病毒防禦。即使仍有病毒釋放,後代成功進入下一輪複製的機會也可能下降。
病毒總量同時受到產生和損失的影響。新顆粒不斷生成,已有顆粒也在失去感染能力或被清除。當新產生的數量低於損失的數量,病毒總量就會下降。研究者用靶細胞限制模型分析其中的細胞數量變化,也會在模型中加入免疫反應等因素,研究各個過程對增長曲線的影響。

可感染細胞的數量和局部免疫反應會持續變化。現實中的病毒沒有一個統一、固定的人口上限,不同條件下測到的數量峯值也會不同。
人口滿了以後 複製會暫停
《擴散領域》將病毒增殖安排在細胞內的複製核心中。玩家通過點擊施加定向推力,把病毒送進核心;單位在圈內完成一輪旋轉,就會生成新的病毒。加速片段能夠提高複製速度,壓縮片段則能防止新單位因應力彈射離開,幫助維持核心附近的複製。
遊戲另外設定了隊伍的人口上限。這是一個明確的單位數量規則,與現實中不斷變化的生物學限制有區別。達到上限時,即使已有可用的細胞和複製單位,新的複製仍會受到阻止。只有隊伍中的單位被消滅或被消耗,總數下降,纔會重新出現可用名額。
加速片段可以縮短產生後代所需的時間,卻無法在滿員時增加總數。如果關卡要求達到指定病毒數量,現有單位需要儘量保留;如果還要繼續複製、獲得新的代際和突變,部分舊單位的損失則可能爲後代騰出位置。

佔用名額的單位有什麼能力
遊戲中的病毒每複製一次,後代的代際就增加一代。按照遊戲規則,代際提高會增加突變概率,新的表面抗原或基因片段也可能在複製過程中出現。人口達到上限後,這些變化會隨着複製暫停而受到影響。隊伍裏的病毒很多,仍可能需要等待一次減員,才能繼續產生下一代。
已有單位的能力也會影響後續擴張。每個病毒只有四個基因槽,拾取的片段無法丟棄。刺突蛋白片段用於進入細胞,出芽蛋白片段用於離開細胞。承擔複製和轉移的單位,還要在有限的槽位中容納其他功能。

抗原遮蔽會使範圍內的病毒失去表面抗原,降低被識別的風險,同時讓這些單位失去複製能力。它們仍然佔用人口名額。即使隊伍保持較高數量,能在下一處細胞中繼續產生後代的單位,也可能已經減少。
隨着增殖,細胞膜部件逐漸耗盡,細胞凋亡會清除內部所有病毒。已經離開這處細胞的病毒還可能保留複製和通行能力,人口出現空位後,它們可以在其他可用細胞中繼續產生後代。
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