寶可夢朱紫主要玩法就是在野外探索，戰鬥並捕捉精靈，另外還有新增的學院系統、太晶化
一、野外探索
1、寶可夢朱紫爲開放世界遊戲玩法主要就是在野外探索，在野外遭遇寶可夢後進入戰鬥，先使用攻擊將野生寶可夢打至殘血，隨後選擇右小角菜單中的【包包】功能。在包包中選擇使用精靈球捕獲寶可夢。
2、當精靈球在地面搖晃三次，球上的燈光由白轉綠且彈出星星的特效後則表示該寶可夢成功捕獲。
3、在野外探索時經常可以找到精靈球道具，靠近後按下A鍵即可拾取，隨機獲得技能學習器、精靈球及各種道具。
4、在野外探索時按下R鍵可以派出寶可夢自動攻擊周圍的野生寶可夢。
5、擊敗野生寶可夢後可以使當前攜帶的所有寶可夢獲得經驗值，同時還能夠獲得擊敗的野生寶可夢的素材。
6、按下Y鍵可以打開地圖，ZL和ZR鍵可以對地圖進行縮放。轉動右搖桿可以旋轉地圖，按下右搖桿可以將地圖方向重置。地圖中帶有白色的歎號的黃色圖標爲主線目標所在位置。
7、精靈球圖標寶可夢中心的位置，已經到訪過的寶可夢中心會帶有白色翅膀標記，在地圖上選中後按下A鍵可以快速傳送至該寶可夢中心。
8、每個寶可夢中心都有綠紅藍三種顏色的櫃檯。在綠色櫃檯處可以花費LP和各種材料製作技能學習器，紅色櫃檯可以治療我們當前攜帶的寶可夢，在迷路時也可以在紅色櫃檯處問路。藍色櫃檯處可以購買或賣出各種道具。
9、在商店中一次性購買10個精靈球會額外獲得1個白色紀念球。
二、學院系統
1、在學院中我們可以通過大堂的閘機或教室的入口來切換地點。當某項房間中有額外展開時會出現紅色歎號。
2、在帶歎號的房間中與老師們交談可以接受額外的任務或進行交談。完成任務或對應的交談後可以提高與對應老師的好感度。
3、在校園大廳的櫃檯處可以選擇課程。在課程列表中我們可以選擇當前已經解鎖的任意課程，課程名稱後的數字代表當前的課程節數。
三、戰鬥系統
1、在對戰界面左下角爲己方出戰的寶可夢信息，包括名稱、等級和生命值情況。界面右上角爲對方的寶可夢信息。信息做左側的精靈球圖標代表當前隨身攜帶的寶可夢數量。
2、界面右下角爲菜單功能欄，選擇戰鬥後即可進入技能欄，再通過選中某一技能來攻擊對手。在某些無法戰勝或不想對戰的的對決中可以嘗試使用【逃跑】功能脫離戰鬥。
3、在野外探險時經常可以在路邊見到其他的寶可夢訓練師，靠近對方後按下A鍵可以與其進行寶可夢對戰。在擊敗一定數量的寶可夢訓練師後可以在寶可夢中心找到聯盟負責人領取豪華獎勵。
四、寶可夢相關
1、按下【-】鍵可以打開手機上的寶可夢圖鑑。圖鑑中寶可夢會分爲三種狀態，對戰過但尚未捕獲的會由淺灰色來表示。
2、在寶可夢圖鑑中按下X鍵可以查看當前的收錄進度，並根據進度可以獲得多種多樣的獎勵。
3、玩家在探險過程中只能夠隨身攜帶6只寶可夢，如果想要更換隨身攜帶的寶可夢可以按X鍵打開菜單，選擇【盒子】一欄。在盒子中可以將已經捕獲的寶可夢和隨身攜帶的寶可夢進行替換。
五、太晶化
1、在戰鬥過程中進入技能選擇界面後，按下R鍵後再使用任意技能即可使寶可夢進入太晶化狀態。
2、太晶化僅能使用一次且六隻寶可夢共享使用次數，使用過太晶化後必須前往寶可夢中心休息才能再次使用。
3、在本作中每個寶可夢均有自己的太晶化屬性，在寶可夢的屬性界面可以查看。以下圖所示的泥泥鰍爲例，該寶可夢原本的屬性爲【水】和【地面】，而太晶化屬性爲【電】。
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